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聚焦UEGW2025:真菌组让食管鳞癌免疫化疗疗效“有据可循”

2025-10-13作者:论坛报马山资讯
原创

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2025年10月4—7日,第33届欧洲消化疾病周(UEGW)在德国柏林举行。中国医学论坛报今日消化将紧密关注这一行业盛事,深入呈现大会发布的前沿科研与临床精华,助力广大读者同步学术前沿。

今天为大家分享南方医科大学珠江医院刘乐博士在UEGW 2025上发布的一项新研究

  • 报告题目:肠道真菌组特征可预测食管鳞状细胞癌新辅助免疫化疗疗效:一种基于机器学习并经实验验证的方法(GUT MYCOBIOME SIGNATURES PREDICT NEOADJUVANT IMMUNOCHEMOTHERAPY RESPONSE IN ESOPHAGEAL SQUAMOUS CELL CARCINOMA: A MACHINE LEARNING APPROACH WITH EXPERIMENTAL VALIDATION)

  • Session:Oncobiome

  • 报告时间:10月6日 8:30-8:42(欧洲中部夏令时)


引言
尽管新辅助免疫化疗(NICT)已取得一定进展,但食管鳞状细胞癌(ESCC)的预后仍然不佳。不同患者的治疗结果差异显著,因此,识别可靠的预测生物标志物至关重要。肠道微生物组影响免疫治疗疗效的证据逐渐增加,但尚未有人系统阐明真菌微生物组对于ESCC的NICT结果有何作用,导致个体化治疗策略的开发领域存在一个巨大的空白。


研究目的与方法
本研究旨在识别ESCC患者的肠道真菌组特征,并构建基于真菌生物标志物的NICT反应预测模型。研究者对68例ESCC患者(NICT前后各取粪便,共136份)及19名健康对照者(HC)进行内部转录间隔区2(ITS2)测序,根据肿瘤退缩分级(TRG)将患者分为反应者(R,n=26)与非反应者(NR,n=42),并从真菌微生物组多样性、群落组成、共现网络及功能通路等维度开展综合比较。研究人员采用森林之神(Boruta)算法进行特征筛选,识别真菌标志物,随后以多层感知机(MLP)为分类器并进行五折交叉验证构建预测模型。此外,研究者还建立ESCC异种移植模型,通过粪菌移植(FMT)与靶向真菌干预,探究肠道真菌组与免疫相互作用的因果证据。


结果

与健康对照者相比,ESCC患者存在显著的真菌组失衡,表现为α多样性降低与明显的β多样性轮廓分离。在基线时,ESCC患者肠道内富集微小红酵母、雅致放射毛霉及若干念珠菌属物种。反应者较非反应者的基线真菌更加具有多样性,包括季也蒙毕赤酵母、博伊丁假丝酵母、真皮毛孢子菌及隐球菌属;而非反应者以酿酒酵母、光滑中濑酵母及致病性念珠菌(光滑念珠菌、近平滑念珠菌、白色念珠菌)为主。反应者的真菌共现网络更为复杂且稳定,网络密度与聚类系数更高。NICT后,两组的多样性均有一定恢复,并且多种潜在有益的真菌显著增加。功能通路分析提示,反应者与非反应者存在不同的代谢与生物学途径谱。经Boruta筛选,研究者共识别到具有高预测价值的23个属水平与22个物种水平的真菌生物标志物。基于属水平标志物的MLP模型在训练集与测试集的曲线下面积(AUC)分别为90.2%与91.9%,与基于物种水平标志物的模型性能相当。在动物实验中,接受R-FMT的小鼠较NR-FMT组肿瘤生长趋势更低,CD8⁺T细胞浸润更多。值得注意的是,补充博伊丁假丝酵母可与抗PD-1治疗产生协同效应,而去除酿酒酵母可增强治疗敏感性。


结论

该研究结果证明,肠道真菌组可作为预测ESCC患者NICT应答的有力指标。基于真菌生物标志物的机器学习模型可实现大于90%的预测准确度。实验验证不仅支持特定真菌与抗肿瘤免疫间有一定联系,也说明了针对性地调控真菌组可提升免疫治疗疗效。这个预测与干预相结合的策略,为ESCC精准治疗提供了一个全新框架,有望从根本上改变这一难治性肿瘤的临床决策模式并优化治疗结局。



内容来自UEGW 2025官网



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