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炎症性肠病患儿，什么情况下需要进行基因检测?_

2022-12-14作者：论坛报小塔资讯

非原创

炎症性肠病（IBD）是一组原因不明的主要累及消化道的慢性非特异性炎症性疾病，包括克罗恩病（CD）、溃疡性结肠炎（UC）和未定型IBD（IBDU）。IBD最早发现于西方国家，在过去的数十年，其发病率呈上升趋势。近年来，在亚洲、南美等新兴工业化国家，IBD发病率逐年增长，目前已成为一类影响人类健康的全球性疾病。IBD病因尚不完全清楚，目前一致认为是基因、环境、微生物及免疫因素共同参与，相互影响的结果。IBD通常被认为是一种多基因疾病。早期研究显示，IBD的单卵双胞胎共患率高、有家族聚集现象。目前通过大规模全基因组研究（GWAS）发现了200多个基因位点，包含300多个候选基因与IBD有关。

20%~30%的IBD患者初次发病年龄在20岁以下。儿童IBD占所有IBD患者的20%~25%，其发病率在全球范围内呈现增长趋势。文献报道儿童IBD发病率为0.47/10万~15.9/10万。

根据蒙特利尔分型，起病年龄＜17岁为儿童IBD。

在后来的巴黎分型中对儿童IBD做了进一步细化：

起病年龄在10~17岁为A1b；

起病年龄＜10岁为A1a，称为早发IBD（EO-IBD）；
＜6岁为极早发IBD（VEO-IBD）；
＜2岁为婴儿型IBD（IO-IBD）；
＜28 d为新生儿型IBD（neonatal IBD）。

与成人及大年龄段儿童IBD不同之处在于，VEO-IBD，尤其IO-IBD，起病年龄早，临床过程复杂，发病与单基因突变关系更为密切。这些单基因缺陷多与原发性免疫缺陷病有关。

IBD 发病相关基因

单基因缺陷导致细胞因子信号传导异常、T 淋巴细胞免疫耐受缺陷、上皮细胞屏障障碍、中性粒细胞功能障碍、联合或孤立T、B淋巴细胞功能缺陷和高炎症反应，进而出现IBD及IBD样肠炎的表现。目前已发现70多种基因缺陷与IBD的发生有关，详见表1。

IBD患儿行基因检测的适应证

在临床工作中，哪些患儿需要进行基因检测？

（1）起病年龄早，多在6岁以下，尤其<2岁；

（2）病程复杂，临床表现重，很难用单一疾病解释；

（3）有严重肛周病变；

（4）既往有反复感染病史；

（5）有阳性家族史；

（6）常规治疗效果不佳；

（7）早期接受手术治疗；

（8）病理学证实存在细胞凋亡或微绒毛缺失；

（9）合并噬血细胞综合征或早发性肿瘤等情况，提示存在单基因缺陷可能性大，应尽早完善基因检测明确诊断。

通过基因检测，首先可以明确基因缺陷类型，做到明确诊断，指导后续治疗。其次可以发现一些可疑致病突变，进行深入分析及功能验证，为确定新的致病突变及致病途径提供突破口及线索，促进IBD发病机制及治疗方法的研究。最后，对患儿家庭给予遗传学咨询和建议，减轻家庭及社会的负担。

基因检测方法的选择

全外显子基因测序（WES）是目前最常用的二代测序方法。WES是对基因组的所有外显子进行测序，大概占人类基因组序列的2%。WES不仅能够发现已知的基因突变，还能发现一些新的致病基因或相同基因的新发突变位点。所需费用及时间适中，临床工作中可行度高。缺点就是不适用于结构变异及非外显子区域变异。目标序列测序（panel sequencing）主要是对一些选定的基因进行测序，通常是一些已知致病基因或感兴趣的基因。测序准确度更高，所需费用和时间更少，可行度高。但其测序范围只能限定在指定的基因。全基因组测序（WGS），是对整个基因组的所有碱基进行测序。覆盖面最广，能够检测各类基因组变异，特别是结构变异。但所需费用及时间成本高，临床可行性不高。

作者：深圳市儿童医院消化内科苟静　王朝霞

内容节选自《分子诊断技术在儿童炎症性肠病诊治中的意义》

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