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肝细胞癌(HCC)是肝癌最常见和最致命的组织学类型,是世界范围内癌症相关死亡的第二大原因[1]。每年全世界HCC的发病率超过50万,并且逐年上升。慢性HBV/HCV感染、酒精性损伤、非酒精性脂肪性肝病、黄曲霉毒素、肥胖、糖尿病和肝硬化被认为是HCC的主要危险因素[2]。原位肝移植和手术切除是目前治疗肝癌最有效的方法,虽然索拉非尼和瑞戈非尼已被用于HCC的一线二线全身化疗,但对其耐药导致高病死率的担忧日益增加。大多数HCC患者被确诊时已为疾病晚期,错过了最好的治疗时机。另一方面,HCC易扩散转移、术后易复发,导致HCC患者术后5年的转移或复发率仍然很高,生存期较短[3]。因此,需要更多可靠的生物标志物用于HCC的诊断、治疗和监测。越来越多的研究发现环状RNA (circular RNA,circRNA)在HCC的发生发展中发挥着重要的调控作用。
1. circRNA概述
circRNA于1976年在类病毒颗粒上被首次发现[4]。其通过反式剪接使3’端和5’端以共价键相连接形成1个闭合环状结构。得益于其闭合的环状结构,circRNA对核酸外切酶不敏感。已知的circRNA的功能机制可以大致分为四类: (1)作为miRNA海绵;(2)调控转录过程;(3)与RNA结合蛋白(RNA-binding proteins,RBP)相互作用;(4)参与肽或蛋白质翻译。circRNA具有丰富性、动态性、保守性、稳定性,这些特性使circRNA在作为新型临床诊断相关生物标志物的开发应用上具有明显优势。新的证据表明,circRNA在HCC的发生和发展中发挥重要作用,并参与细胞增殖、肿瘤转移、免疫逃逸、代谢和耐药[5]。
2.circRNA在HCC发生发展中的作用
HCC患者晚期表现之一是肿瘤细胞的侵袭和转移,有侵袭和转移的HCC患者预后不佳,circRNA表达失衡可能是HCC患者侵袭和转移发生的原因之一。在HCC中,circASAP1 (hsa_circ_0085616)通过调控miR-326/miR-532-5p/MAPK1轴增强HCC细胞的增殖和侵袭能力,此外,通过调节miR- 326/miR-532-5p-CSF-1通路介导肿瘤相关巨噬细胞浸润[6]。Lin等[7]发现circGprc5a可以通过海绵化miR- 1283激活Hippo信号通路关键下游蛋白YAP1/TEAD1,促进HCC的进展。circ_0061395通过调控miR-1182/SPOCK1通路,促进HCC细胞的发展,为HCC提供了一种新的靶向治疗方法[8]。Liu等[9]发现CircSTIL在HCC组织和细胞中表达上调。CircSTIL敲除通过调控miR-345-5p/AQP3通路减少细胞增殖、迁移和侵袭,抑制HCC进展。与此类似,circEIF3I在HCC中是一种致癌circRNA,下调circEIF3I可以通过circEIF3I/miR-526b-5p/HGF/c-Met通路延缓HCC肿瘤生长[10]。circ_0011232通过miR-503-5p/AKT3轴促进HCC进展,可能为HCC提供一种新的治疗策略[11]。circCBFB通过抑制miR-424-5p,使ATG14表达上调,从而促进HCC细胞增殖和自噬[12]。上述研究表明,致癌circRNA在HCC中通常上调,主要通过充当miRNA海绵促进肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭等进程。hsa_circ_0062682的上调促进了HCC细胞增殖、迁移和侵袭,其功能通过与YBX1及其他RBP相互作用实现[13]。SCD-circRNA2在HCC组织中表达上调,其中RBP RBM3以SCD-circRNA2依赖的方式促进HCC细胞增殖[14]。已有诸多研究表明,circRNA能够起到抑制HCC进展的作用。circPTTG1IP是HCC中的一种新型肿瘤抑制circRNA,低水平的circPTTG1IP通过miR-16-5p/RNF125/JAK1轴促进HCC的发展[15]。在HCC中,circRNA DOCK1和SMAD2表达升高,miR-654-5p表达降低,干扰circRNA DOCK1可通过调控miR-654-5p/SMAD2轴抑制HCC细胞的增殖、侵袭和迁移[16]。在体内外实验中,过表达circITCH可通过海绵化miR-184抑制细胞增殖、迁移、侵袭,促进细胞凋亡,而敲低circITCH则相反[17]。circFGGY通过调控miR-545-3p/Smad7轴抑制细胞生长、侵袭和肝细胞上皮-间充质转化[18]。在不充分射频消融后残留HCC中,circ-BANP通过与let-7f-5p结合,抑制HCC细胞的增殖、迁移和上皮-间叶细胞转化形成[19]。研究[20]表明,circDLC1可与RNA结合蛋白HuR结合,进而减少HuR与MMP1 mRNA的相互作用,从而抑制MMP1的表达,最终抑制HCC的进展。致癌circRHOT1还通过将TIP60(也称为KAT5)招募到NR2F6的启动子并增强其转录,从而抑制HCC的增殖和转移[21]。抑癌circRNA表达降低是肝癌的主要危险因素,对肿瘤细胞的增殖、侵袭和转移均有不利影响。表 1列举了部分在HCC中失调的circRNA的表达和功能。
表 1 circRNA在HCC中的生物学功能
circRNA | 表达 | 生物学功能 | 机制 | 文献 |
circASAP1 | 上调 | 促进细胞增殖、侵袭、转移,介导肿瘤相关巨噬细胞浸润 | miR-326/miR-532-5p /MAPK1轴、miR-326/miR-532-5p-CSF-1轴 | [6] |
circGprc5a | 上调 | 促进细胞增殖 | miR-1283/YAP1/TEAD1轴 | [7] |
circ_0061395 | 上调 | 促进细胞增殖、侵袭、转移 | miR-1182/SPOCK1轴 | [8] |
circ-STIL | 上调 | 促进细胞增殖、侵袭、转移,抑制细胞凋亡 | miR-345-5p/AQP3轴 | [9] |
circEIF3I | 上调 | 促进细胞增殖、上皮-间质转化、转移、侵袭,抑制细胞凋亡 | miR -526b-5p-HGF/c-Met轴 | [10] |
circ_0011232 | 上调 | 促进细胞增殖、集落形成、转移和侵袭,抑制细胞凋亡 | miR-503-5p/AKT3轴 | [11] |
circCBFB | 上调 | 促进细胞增殖和自噬,抑制细胞凋亡 | miR-424-5p/ATG14轴 | [12] |
hsa_circ_0062682 | 上调 | 促进集落形成、转移、增殖,影响索拉非尼敏感性 | RBP YBX1相互作用 | [13] |
SCD-circRNA2 | 上调 | 促进细胞增殖、侵袭、转移 | RBP RBM3相互作用 | [14] |
circPTTG1IP | 下调 | 抑制细胞增殖、集落形成、侵袭 | miR-16-5p/RNF125/JAK1轴 | [15] |
circRNA DOCK1 | 上调 | 干扰circRNA DOCK可以抑制HCC细胞增殖、侵袭和转移 | miR-654-5p/SMAD2轴 | [16] |
circITCH | 下调 | 抑制细胞增殖、转移、侵袭,促进细胞凋亡 | miR-184 | [17] |
circFGGY | 下调 | 抑制细胞增殖、侵袭和上皮-间质转化 | miR-545-3p/Smad7轴 | [18] |
circ-BANP | 上调 | 抑制细胞增殖、转移和上皮-间质转化 | 与let-7f-5p相互作用,TLR4/STAT3轴 | [19] |
circDLC1 | 下调 | 抑制细胞增殖、转移 | 与HuR相互作用,circDLC1-HuR-MMP1轴 | [20] |
circRHOT1 | 上调 | 促进细胞增殖、侵袭、转移 | NRF26 TIP60转录调控 | [21] |
在病毒感染过程中,circRNA表达谱发生变化,可调节免疫系统功能。例如,最近的一项研究[22]发现,HCC细胞通过外泌体分泌circUHRF1。临床生理表型显示circUHRF1表达高的患者中肿瘤体积较大,血液中NK细胞比例较低,微血管浸润较多。Kaplan-Meier生存分析显示,circUHRF1高表达患者伴随临床预后不良。circUHRF1可以通过上调NK细胞TIM-3的表达来抑制NK细胞分泌IFN-γ和TNF-α。该研究显示,肿瘤中血浆外泌体circUHRF1水平与NK细胞浸润水平呈负相关。研究者甚至提出了circUHRF1可能促进肝癌患者对程序性死亡受体1免疫治疗产生耐药的假设,但是证据仍然不足。来自HCC细胞的外泌体circGSE1通过调控miR324-5p/TGFBR1/Smad3轴诱导Treg扩增,从而促进HCC的进展[23]。据报道[24],hsa_circ_0003410在HCC中明显上调,通过调节miR-139-3p/CCL5轴增加M2/M1巨噬细胞比率,促进HCC的进展。下调hsa_circ_0074854通过与HuR相互作用和抑制外泌体介导的巨噬细胞M2极化,从而在体内外抑制肝癌的迁移和侵袭[25]。上述研究证实了circRNA可以通过调节HCC患者的免疫系统来影响HCC的发展和预后,未来circRNA也许会成为理想的免疫治疗靶点。
近年来,circRNA与HCC代谢的相互作用引起了广泛关注。通过circRNA调控HCC细胞的代谢,可促进或抑制物质代谢的某些关键酶,从而改变HCC的增殖、侵袭、分化和转移等进展过程。因此,在一定程度上,一些参与代谢调控的circRNA可以作为HCC的潜在生物标志物。在缺氧条件下,circMAT2B通过海绵介导miR-338-3p上调PKM2的表达,增强糖酵解,从而促进HCC的进展[26]。在氧化应激条件下,circ-SPECC1通过miR-33a调控TGFβ2和自噬,促进HCC发生[27]。同样的,HCC细胞中circ_0091579部分通过miR-490-5p/CASC3轴促进细胞增殖、迁移、侵袭和糖酵解[28]。circRPN2通过加速烯醇化酶1 (ENO1)降解和调控miR-183-5p/FOXO1轴抑制HCC有氧糖酵解和转移,表明circRPN2可能是肝癌的治疗靶点[29]。在HCC中,下调circ-CFH通过调控miR-377-3p/RNF38轴,可抑制细胞增殖、迁移、侵袭和糖酵解,从而抑制HCC的发展[30]。hsa_circ_0001806在HCC组织和细胞中表达上调,过表达hsa_circ_0001806通过调控miR-125b/HK2轴促进肝癌细胞增殖、迁移和糖酵解,抑制细胞凋亡[31]。
3.circRNA与HCC耐药
目前,多激酶抑制剂、单克隆抗体和免疫检查点抑制剂是治疗晚期HCC的主要分子靶向治疗方法。然而,治疗结果却差强人意,主要问题是难以避免的耐药。越来越多的证据表明,circRNA在HCC耐药的发展中起关键作用。circ-001241在HCC组织和细胞中显著上调,通过调节miR-21-5p/TIMP3轴促进肝癌索拉非尼耐药[32]。circARNT2通过靶向miR-155-5p/PDK1轴抑制肝癌细胞对顺铂的敏感性[33]。hsa_circRNA_102049过表达可以通过海绵化hsa-miR-214-3p上调RELN基因的表达,增加HepG2细胞和Huh-7细胞对索拉非尼的敏感性[34]。Lu等[35]研究发现,在抗PD-1治疗反应不良和HCC术后预后不良的患者中circTMEM181表达升高。HCC细胞通过外泌体circTMEM181作用于巨噬细胞,从而增加其CD39的表达。这一过程与肿瘤细胞上的CD73协同激活eATP-腺苷通路,导致肿瘤环境中的腺苷升高,从而损害CD8+ T淋巴细胞功能,引起抗PD-1免疫治疗的耐药性。circUBE2D2的高表达与HCC患者的低生存率显著相关,体外实验[36]证明,circUBE2D2可通过miR-889-3p/LDHA轴加速HCC的糖酵解和索拉非尼的耐药,这为HCC治疗提供了一种新的方法。Weng等[37]研究通过RNA测序(RNA-seq) 在索拉非尼耐药的HCC组织中鉴定出了一种新型circRNA,circFOXM1。在功能上,circFOXM1显著抑制HCC的生长,调控索拉非尼耐药。circFOXM1下调可能通过释放更多的游离miR-1324和抑制MECP2的表达来调控索拉非尼耐药。circFBXO11在HCC组织中显著上调,通过海绵化miR-605,从而靶向FOXO3蛋白,FOXO3靶向ABCB1的启动子区,促进ABCB1的表达。总之,本研究揭示了circFBXO11/miR-605/FOXO3/ABCB1在HCC中介导奥沙利铂耐药的机制[38]。上述研究阐明了circRNA在介导HCC耐药中的作用,为晚期肝癌患者克服耐药提供了新的见解。必须进一步明确耐药的机制,并探索circRNA在分子靶向药物耐药中的作用。
4.HBV相关HCC
HBV是导致肝癌的主要因素。circRNA已被证实与HBV诱导的肝癌密切相关。有研究[39]从50 327个circRNA中,鉴别出1 187个circRNA在HBV相关HCC和HBV无症状携带者之间的表达存在显著差异。其中circRNA1002在HCC血清和组织中均显著下调,提示circRNA1002可以作为HBV相关HCC的生物标志物。在HCC组织和HBV转染的肝癌细胞中,circBACH1和MAP3K2表达升高,而miR-200a-3p表达降低。circBACH1缺失或miR-200a3p过表达可抑制HBV转染肝癌细胞中的HBV复制、增殖和转移[40]。circ_0027089作为一种致癌基因,通过竞争性靶向miR-136-5p调控NACC1的表达,促进HBV相关HCC的发生发展[41]。circ-RNF13可能通过调控miR-424-5p/ TGIF2轴抑制HBV相关HCC恶性进展和HBV感染[42]。HBV可以产生circRNA,但是其功能尚未明确。Zhu等[43]研究发现了一种由HBV产生的新型circRNA HBV_circ_1。生存分析显示,HBV_circ_1阳性患者的生存率明显低于HBV_circ_1阴性患者。并且,瞬时表达HBV_circ_1可以增强肝癌细胞增殖、迁移和侵袭能力,抑制细胞凋亡。此外,HBV_circ_1还与周期蛋白依赖性激酶1的相互作用,调节细胞增殖。血清外泌体hsa_circ_0028861在HCC中的表达低于慢性HBV和肝硬化,并且,hsa_circ_0028861联合AFP鉴别HCC与慢性HBV和肝硬化的ROC曲线下面积(AUC)为0.86,具有更好的诊断能力[44]。上述数据不仅为了解HBV相关HCC的发生机制和进展提供了新的线索,而且为治疗药物的开发提供了新的靶点。表 2概括了circRNA在免疫、代谢、耐药及HBV相关HCC中的生物学功能。
表 2 HCC中circRNA的表达及功能
circRNA | 表达 | 生物学功能 | 机制 | 文献 |
免疫方面 | ||||
circUHRF1 | 上调 | 参与免疫抑制 | miR-449c-5p/TIM-3轴 | [22] |
circGSE1 | 上调 | 诱导Tregs扩增,促进HCC发展 | miR324-5p/TGFBR1/Smad3轴 | [23] |
hsa_circ_0003410 | 上调 | 增加M2/M1巨噬细胞的比率,促进HCC发展 | miR-139-3p/CCL5轴 | [24] |
hsa_circ_0074854 | 上调 | 下调hsa_circ_0074854抑制肝癌的迁移和侵袭 | 下调hsa_circ_0074854与HuR相互作用和抑制外泌体介导的巨噬细胞M2极化 | [25] |
代谢方面 | ||||
circMAT2B | 上调 | 增强糖酵解,促进HCC发展 | miR-338-3p/PKM2轴 | [26] |
circ-SPECC1 | 下调 | 在氧化应激条件下促进细胞增殖,抑制细胞凋亡 | 海绵化miR-33a调节TGF-β2和自噬 | [27] |
circ_0091579 | 上调 | 抑制细胞增殖、迁移、侵袭和糖酵解 | miR-490-5p/CASC3轴 | [28] |
circRPN2 | 下调 | 抑制有氧糖酵解和转移 | 加速ENO1降解和调节miR-183-5p/FOXO1轴 | [29] |
circ-CFH | 上调 | 促进细胞增殖、迁移、侵袭和糖酵解 | miR-377-3p/RNF38轴 | [30] |
hsa_circ_0001806 | 上调 | 促进细胞增殖、转移和糖酵解,抑制细胞凋亡 | miR-125b/HK2轴 | [31] |
耐药方面 | ||||
circ-001241 | 上调 | 调节索拉非尼耐药 | miR-21-5p/TIMP3轴 | [32] |
circARNT2 | 上调 | 调节顺铂耐药 | miR-155-5p/PDK1轴 | [33] |
hsa_circRNA_102049 | 下调 | 调节索拉非尼耐药 | hsa-miR-214-3p/RELE | [34] |
circTMEM181 | 上调 | 调节抗PD-1耐药 | ATP-腺苷途径 | [35] |
circUBE2D2 | 上调 | 促进糖酵解和索拉非尼的耐药 | miR-889-3p/LDHA轴 | [36] |
circFOXM1 | 上调 | 调控索拉非尼耐药 | miR-1324/MECP2 | [37] |
circFBXO11 | 上调 | 调节奥沙利铂耐药 | miR-605/FOXO3/ABCB1轴 | [38] |
HBV相关HCC | ||||
circRNA1002 | 下调 | 血清生物标志物 | 激素通路与细胞-细胞相互作用过程 | [39] |
circBACH1 | 上调 | 促进HBV复制、细胞增殖和转移 | miR-200a-3p/MAP3K2 | [40] |
circ_0027089 | 上调 | 促进细胞增殖、转移和侵袭,抑制细胞周期阻滞和凋亡 | miR-136-5p/NACC1 | [41] |
circ-RNF13 | 上调 | 促进细胞增殖、集落形成、转移和侵袭,抑制细胞凋亡 | miR-424-5p/TGIF2 | [42] |
HBV_circ_1 | 上调 | 促进细胞增殖、转移和侵袭,抑制细胞凋亡 | 与周期蛋白依赖性激酶1相互作用 | [43] |
虽然HCC是原发性肝癌最常见的类型,但早期缺乏准确的生物标志物,导致HCC确诊往往较晚。随着分子生物标志物研究的进展和基因组学的发展,circRNA已作为一种新型的液体活检生物标志物被人们所认识。circRNA可在组织、外泌体、血浆、血清、唾液、尿液、脑脊液和乳汁等样本中检测到,其表达谱表现为细胞特异性或阶段特异性(表 3)。
表 3 circRNA作为HCC诊断和预后的生物标志物
Table 3. circRNA as a biomarker for the diagnosis and prognosis of HCC
circRNA | 生物样本 | 生物标志物相关性 | 文献 |
hsa_circ_0028861 | 血清 | 诊断 | [44] |
hsa_circ_0001821 | 血浆 | 诊断 | [45] |
circ_0064286 | 血清 | 诊断 | [46] |
hsa_circ_0006091 | HCC组织 | 诊断 | [48] |
circ_0000437 | 血清、HCC组织 | 诊断、预后 | [49] |
circMED27 | 血清 | 预测乐伐替尼耐药、预后 | [50] |
hsa_circ_0005986 | 血清、HCC组织 | 预后 | [51] |
CSMARCA5 | HCC组织 | 预后 | [52] |
circRNA_101237 | 血清、HCC组织 | 预后 | [53] |
研究[45]表明,hsa_circ_0001821在HCC的血浆中表达上调,AUC为0.692,提示血浆hsa_circ_0001821可能是一种新的HCC诊断标志物。其他研究[46]表明,hsa_circ_0064286和hsa_circ_ 0000475在HCC患者中均显著下调,与ALP、ALT、AST、AFP、胆红素水平呈负相关。circ_0064286的敏感度和特异度较高,分别为88.3%和96%,可能作为HCC诊断的潜在生物标志物。一项研究[47]对血清/血浆circ RNA或circRNA联合AFP检测在HCC诊断中的准确性进行了荟萃分析,结果显示,circRNA的敏感度为0.82(95%CI: 0.78~0.85),特异度为0.82(95%CI: 0.78~0.86)。AFP的敏感度为0.65(95% CI: 0.61~0.68),特异度为0.90(95%CI: 0.85~0.93)。circRNA的AUC为0.89(95%CI: 0.86~0.91),AFP的AUC为0.77(95%CI: 0.74~0.81)。circRNA和AFP联合检测的敏感度为0.88(95%CI: 0.84~ 0.92),特异度为0.86(95%CI: 0.80~0.91),AUC为0.94 (95%CI: 0.91~0.96)。Zhang等[48]也证明hsa_circ_0006091 &AFP与hsa_circ_0006091&RGS12联合诊断具有重要意义,可作为HCC诊断的分子标志物。以上结果说明,血清/血浆circRNA是适合临床诊断HCC的生物标志物,circRNA与AFP的联合检测提高了HCC诊断的准确性,circRNA可作为监测HCC发生发展的生物标志物。然而,目前还没有一种方便可靠的血清circRNA生物标志物。
Chen等[49]发现,无论在HCC肿瘤组织还是血清中,肿瘤组circ_0000437表达显著上调,且与TNM分型、分化程度、肿瘤大小、BCLC分期相关(P<0.05)。此外,较差的总生存期与circ_0000437的高表达相关,circ_0000437在血清中诊断HCC的AUC为0.928 1,上述结果提示circ_0000437可能作为HCC患者诊断和预后的一种新的生物标志物。最近一项研究[50]表明,circMED27在HCC血清中显著升高,与HCC患者不良临床特征和不良预后相关,并且促进肝癌细胞对乐伐替尼的耐药,提示circMED27可作为接受乐伐替尼治疗的HCC患者的潜在治疗靶点,并可能作为预测乐伐替尼耐药HCC的一种潜在的生物标志物。除此之外,hsa_circ_0005986的高表达与生存改善相关,是总体生存率和无进展生存率的独立预后因素[51]。此外,DHX9在HCC中表达显著上调,并抑制cSMARCA5的产生(hsa_circ_0001445)。DHX9是一种RNA解旋酶,可结合并抑制两侧反向互补序列的配对,从而阻止circRNA的产生。CSMARCA5通过SMARCA5/miR-17-3p/miR-181b-5p/TIMP3通路抑制HCC的生长。HCC组织中cSMARCA5的降低与肿瘤生长和转移的增加有关,使其成为肿瘤切除后患者的独立预后指标[52]。circRNA_101237在HCC患者的肿瘤组织和血清中表达上调,且与circRNA_101237的表达与肿瘤大小、淋巴结转移、远处转移及TNM分期有关。单因素和多因素分析显示,血清circRNA_101237水平是HCC患者生存预后的独立预测因素[53]。
6.小结
circRNA已经成为肿瘤分子生物学领域研究的新热点,目前circRNA在HCC发展、诊疗方面的研究尚处于初步阶段,仍存在许多问题。首先,通过RNA测序已在HCC中鉴定出了上千种circRNA,但只有少量circRNA功能被研究。如何从大量的候选circRNA中挑选发挥关键作用且具有临床价值的circRNA是一项巨大的工程。其次,目前对于circRNA的研究主要集中于肝癌组织,对于外周血、外泌体、尿液和唾液等分泌的circRNA研究较少。对circRNA进行多种类样本的全方位研究,有利于提高对circRNA复杂的调控网络的认知。重视体液中circRNA的研究,有利于开发用于肝癌筛查和预后监测的circRNA检测试剂盒。综上所述,筛选出发挥关键调控功能的circRNA,阐明其靶向分子和信号通路,将有助于发掘circRNA作为HCC治疗靶点的巨大临床价值。
苗淑莹, 杨军, 管文燕, 等. 环状RNA在肝细胞癌发生发展及诊疗中的作用[J]. 临床肝胆病杂志, 2023, 39(8): 1983-1991. DOI: 10.3969/j.issn.1001-5256.2023.08.033.
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