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成果名称:53026名成人健康与疾病血浆蛋白质组图谱
Atlas of the plasma proteome in health and disease in 53,026 adults
发表期刊:《细胞》Cell(IF:45.6)
通讯作者:郁金泰
主要作者单位:复旦大学附属华山医院
该研究绘制的人类健康与疾病蛋白质组图谱揭示了血浆蛋白在疾病诊断、预测和治疗中的应用价值,有助于早期检测、精准分层和个性化治疗。基于该开放获取图谱,研究人员可深入探索疾病发病机制,开发生物标志物和预测/诊断模型,探寻治疗靶点,为精准医学发展奠定基础。
该研究通过深入分析53026名个体的血浆蛋白质组数据,跨越了14.8年的中位随访期,建立了全面的蛋白质组图谱。该图谱涵盖了2920种血浆蛋白质与406种既往患病、660种随访新发疾病以及986种健康相关表型,揭示了168100个蛋白质-疾病关联和554488个蛋白质-表型关联。研究中发现超过650种蛋白质与至少50种疾病存在联系,而超过1000种蛋白质表现出性别和年龄的异质性,这些发现加深了对疾病间共享和特异分子机制的理解,揭示了不同人群在疾病易感性上的差异。研究人员还发现免疫系统相关通路在绝大部分疾病中富集,强调了炎症在人类健康中的重要作用。
利用蛋白质组学特征对660种疾病进行聚类,能够根据其共享的生物学特性将这些疾病联系起来,从而重新审视疾病的类别和亚型。研究团队进一步揭示了该亚群的特征性生物学通路,将生物学上相关的疾病联系在一起。
为了精准评估血浆蛋白质组学在疾病预测和诊断中的临床价值,研究利用人工智能与大数据分析技术,识别出了具有潜在诊断和预测价值的生物标志物,发现基于蛋白质的模型在183种疾病中的AUC值超过0.80,明显优于基于人口统计学的模型。值得一提的是,GDF15被发现是预测和诊断多种疾病的关键蛋白,其在对200种疾病的预测中的重要度均排名第一,这表明GDF15在疾病的早期识别和风险评估中具有重要作用,可能成为一个重要的生物标志物。此外,EDA2R、NTproBNP、COL9A1和NEFL等蛋白也在多个疾病中表现出良好的预测和诊断性能。
同时,通过整合蛋白质数量性状位点(pQTL)和疾病全基因组关联研究(GWAS)数据,本研究使用孟德尔随机化分析(MR)确定了474个具有潜在因果关联的蛋白质-疾病对,其中与神经精神疾病相关的蛋白质有18个。通过检索DrugBank和Therapeutic Target Database两个数据库中的药物靶点信息,本研究提供了对25个已知靶点的37种潜在药物重新利用机会,如将BSG重定位作为治疗抑郁症的潜在靶点。最后,通过对MR发现的潜在靶点进行安全性评估,本研究确立了26个具有治疗潜力且安全性良好的新靶点。
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