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在中国逐步调整最严格的大流行管控政策后,对北京地区413例COVID-19新发病例进行了基因组分析,结果表明所有病例均由现有毒株引起。
2022年11月14日至12月20日期间,北京地区90%以上的本地感染病例涉及奥密克戎(Omicron)变异株BA.5.2或BF. 7亚分支。同期输入型病例大多涉及与北京地区优势毒株不同的变异株。
作者表示,这些研究发现可被视为中国疫情现状的缩影。
根据对北京地区COVID-19感染病例的分析,中国逐步调整“动态清零政策”后感染病例数量激增,在此期间,中国未出现新的COVID-19变异株。
《柳叶刀》(The Lancet)发表的一项研究表明,在2022年11月14日至12月20日期间,超过90%的本地感染病例涉及北京优势毒株中的两种现有的奥密克戎(Omicron)变异株亚分支——BA.5.2和BF.7。
作者表示,由于北京人口的特点以及高传染性COVID-19毒株在北京地区的传播情况,这些结果是中国大流行的缩影。
据报道,中国已于2022年11月11日开始逐步调整动态清零政策。逐步解除严格的COVID-19管控政策[包括定向封控(targeted lockdown)、大规模检测(mass testing)和隔离(quarantine)]后,病例数量激增,引发了人们对可能出现新的变异株的担忧。在COVID-19被宣布为全球大流行后的三年时间里,阿尔法(Alpha)、贝塔(Beta)、伽玛(Gamma)、德尔塔(Delta)和奥密克戎等变异株的出现在全球范围内引起多轮传播。
自2019年12月以来,本研究的作者定期收集北京地区输入型病例和本地COVID-19病例的呼吸道样本,并随机选择样本进行分析。在2022年12月之前,未有关于病毒在北京地区本地持续传播的报告。
在这项最新研究中,作者对北京地区2022年检出的COVID-19病例样本进行了分析。使用快速、大规模测序技术生成基因组序列,并使用现有的高质量COVID-19序列分析其进化历程和种群动态。
研究共纳入2881个高质量序列(其中境外输入型病例来自63个国家和地区),在2022年11月14日(感染病例数量开始急剧增加)至12月20日期间,随机选择了413个新样本进行测序。其中350例为本地病例,63例为输入型病例。
对413个新序列的分析表明,其均属于现有已知的COVID-19毒株。2022年11月14日之后,北京地区的优势毒株为BF.7,占本地感染病例的75.7%。另一种奥密克戎变异株亚分支BA5.2占本地感染病例的16.3%。
2022年11月14日之后,北京地区的BA5.2和BF.7有效种群数量均有所增加。BA.5.2有效种群大小在2022年11月14日至25日之间无显著变化,但在2022年11月30日前后急剧增加。与此同时,2022年11月30日前后的BA.5.2感染病例数量也有所增加。自2022年11月14日起,BF.7的种群大小逐渐增加。
研究的通讯作者、中国科学院微生物研究所(Institute of Microbiology at the Chinese Academy of Sciences)的高福教授说:“鉴于变异株对疫情进程的影响,有必要调查中国近期调整COVID-19防控政策后是否出现新的变异株。我们的分析表明,两种已知的奥密克戎变异株亚分支(而非任何新的变异株)是北京地区当前病例数激增的主要原因,而且放眼整个中国,可能同样适用。然而,随着COVID-19在中国的大规模传播,我们有必要继续密切监测疫情,以便尽早发现可能出现的任何新变异株。”
作者承认本项研究存在一些局限性。虽然只对北京地区2022年的数据(而非中国大陆的数据)进行了分析,但作者表示,这些数据可代表全国的情况。由于强制性大规模检测结束,无法获得2022年12月经实验室确认的COVID-19病例数,表明真实感染病例数被低估,导致数据中存在一定程度的抽样偏倚。需要更多的样本来研究奥密克戎变异株亚分支的传播性和致病性。虽然病毒的进化速度可能因变异株的不同而存在差异,但在疫情暴发初期,认为病毒的进化速度是恒定的。
南非斯坦陵布什大学(University of Stellenbosch)的Wolfgang Preiser教授和Dr Tongai Maponga(均未参与本项研究)在本文的相关评论中写道:“我们很高兴看到来自中国的这些急需的数据。令人欣慰的是,该研究并未发现关于新变异株的证据,但这一结果也并非在意料之外:有效控制措施的突然停止可充分解释病例数量的激增。”然而,他们表示,在根据北京地区的数据得出全国情况的结论时仍需谨慎。他们说:“对于一个幅员辽阔、人口稠密的大国,不能根据单个地区的SARS-CoV-2分子流行病学特征推断整个国家的状况。在中国的其他地区,可能会出现其他进化动态,其中可能包括可被人类感染且进一步进化后发生“回溢”(spill back)的动物病毒。”
来源:柳叶刀TheLancet
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