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今日病例｜二代测序在重症肺炎中的应用（下）

2021-10-08作者：论坛报小璐资讯

呼吸非原创

恙虫病可导致多系统和脏器受累，继而引起多器官功能衰竭。该病易被误诊，进而无法采取针对性治疗，效果不佳。所以临床医生一定要详细询问病史，尤其是有无野外接触史，并完善体格检查。另外，采用快速、全面的病原学检测方法（如NGS）可以为疾病救治赢得时间。

本文报告NGS协助诊治重症肺炎、多器官功能衰竭1例。在临床上，发热、呼吸困难、胸部CT示胸腔积液、肺部渗出性病变等并无特异性，高热与其他急性发热性疾病，如鼠型斑疹伤寒、细螺旋体病和登革热等相似，难以鉴别。特别是当疾病为少见或特殊病原菌感染引起时，往往会出现反复更改抗生素后治疗效果不佳，后续治疗无从下手。

分析本例重症肺炎、多器官功能衰竭患者外院误诊原因：①单纯从呼吸系统找病因，根据肺部闻及啰音及胸部X线片等单纯按照呼吸系统疾病治疗；②病史采集不全面、不仔细，对来自流行地区或流行季节去过疫区的人群，以及田野作业或在草丛中坐卧的人群不够重视；③对特征性焦痂及溃疡认识不足或体检不仔细，遗漏特征性体征；对恙虫病缺乏认识或警惕性不高；⑤局限于用传统方法检测病原菌。

分析本例重症肺炎、多器官功能衰竭患者经我院诊治后好转出院原因：①详细询问病史及体格检查；②结合患者多器官功能衰竭全面考虑疾病诊断；③采用快速、全面、无偏倚的检测方法：NGS；③诊断明确后行针对性治疗。

NGS是相对于第一代DNA测序技术而言的新型测序手段。与第一代测序相比，NGS最大的优势在于通量高、成本较低、敏感性高，该方法可以同时测定几百万甚至上亿条DNA或RNA序列，加快了全基因组测序的速度，降低单个碱基测序的成本。细菌、病毒和真菌感染的确诊长期以来主要依靠临床微生物实验室的培养结果，但受培养条件和抗生素使用等因素影响，培养阳性率较低，尤其是在有基础疾病或免疫抑制状态的人群中。基于NGS筛查病原体可以不依赖于培养结果，直接从样本中获得病原体的核酸序列信息，再通过生物信息学的方法对得到的序列进行比对分析，依靠其无偏倚、随机的特性，不仅可以检测已知病原体的基因组，更可以从头组装未知微生物的基因组，后者对新发病原体感染的鉴定能够发挥重要作用。NGS的检测时间最快可少于48 h。

经验及总结

（1）重症肺炎可能是其他疾病导致多系统受累累及肺部所致，需全面寻找病因。

（2）NGS可协助快速诊断特殊病原体感染，急危重症患者的获益较大。

（3）恙虫病可导致多系统和脏器受累，进而出现多器官功能衰竭。

（4）恙虫病易误诊，如误诊为肺炎（细菌）等，需要详细询问病史（如野外接触史等），仔细体格检查（腋下、腹股沟、会阴等隐蔽部位）。

（5）恙虫病东方体为细胞内专性寄生菌，凡是不能进入细胞内的药物（亚胺培南西司他丁、哌拉西林他唑巴坦等）均无效。

（6）诊断明确后针对性使用多西环素可有效治疗恙虫病。

来源：重症肺言作者：中南大学湘雅医院呼吸与危重症医学科李园园，潘频华

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