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重复率虽然只是一个数值，准确来说是个百分比，但却是每位中国作者投稿前的隐忧，这个数值代表的，是你的论文中，有多少内容与现有已发表的论文重复，百分比越高，表示有越多重复内容。一般来说，重复率越高的文章，会被视为有抄袭嫌疑，期刊肯定不会接受重复率太高的论文。 当然，有许多中国作者会觉得无辜，因为他压根没有抄袭的意思，只是基于对英语写作不甚熟悉，在阅读文献时记下了漂亮的句型，用在自己的论文中，但也会被查重软件算进重复内容中，因此大多会在投稿前自己先进行查重，避免投稿后因为重复率过高被拒。
根据发表道德委员会 (COPE) 委托浙江大学学报 Zhang Y 与 Jia X 执行的一项研究（A survey on the use of CrossCheck for detecting plagiarism in journal articles，发表于 2012 年），对期刊编辑进行了查重软件使用情况的调查，该调查包含了英语及非英语国家的期刊编辑，调查针对的查重软件为 CrossCheck。
在 219 份回收问卷中，有 42% 的编辑表示，会在处理投稿的过程中使用 CrossCheck，但在问到对软件的依赖程度时，大多数 (66%) 的编辑表示他们是将 CrossCheck 报告与编辑部的评估报告和同行评审意见合并使用，而少部分的人 (20%) 表示他们只采信软件报告，并将百分比过高的论文直接拒绝；另一小部分的编辑 (10%) 说他们会针对有抄袭嫌疑的部分咨询审稿人的意见，极少数的人 (4%) 会要求作者提出解释。总的而言，编辑无法接受查重结果大于 50% 的稿件并倾向做出『拒稿』的决定。
大部分的编辑不接受直接复制粘帖的内容，作者应该要改写并注明引用来源，但有些编辑能够接受论文中的材料与方法章节里有一些复制粘帖的内容，因为这个部分通常包含技术用语且这些写法没有办法有太大的改变。
从上面的调查结果看来，许多期刊编辑都知道查重软件的限制并慎重的使用它，也会向作者或审稿人进行咨询，甚至，他们似乎也注意到有时候改写是很困难的，所以也能接受这些论文。尽管如此，有些期刊编辑过度依赖软件并直接拒绝百分比过高的稿件是不争的事实。
作者在投稿前可以自己先进行查重，重复比例超过 50% 以上的话就要特别小心，如果重复的内容主要是在材料与方法章节或是无法改写的技术内容的话，可以尝试在投稿信中说明，其余的章节则应该在投稿前尽量进行修改。
如果已经因为重复率而被拒稿了，首先要先了解论文中重复内容过高的部分是哪些，如果期刊有提供查重报告，就会比较好处理。另外，在全面了解自己的论文中重复内容的情况后，也可以试着向期刊编辑解释为何某些部分被查重标出并请求重新考虑拒稿决定，别忘了重申研究的创新性与其对既有文献的贡献。
最后，现在有几种不同的查重软件，不同的软件给出的结果不尽相同，所以如果自己查重的结果跟期刊的不太一样也不要太惊讶，有一点落差是正常的。
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