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mNGS技术应用于感染性疾病的适应证
临床适应证
常规检测能够明确病原学的不做mNGS；
发热或发热症候群；
危重症患者或免疫受损患者不除外感染；
某些局部感染病原学诊断未明；
高度疑似感染但病原学未明且常规抗感染治疗无效；
慢性感染或慢性疾病不除外感染；
不建议无条件情况下普遍进行mNGS。
微生物学适应证
新发病原体，或特殊病原体；
临床怀疑感染，多种传统技术反复检测不能明确；
传统病原学检测结果不能解释临床表现；
了解病原体特殊的毒力表型。
耐药学适应证
有微生物定植的部位不建议耐药性检测；
正常无微生物定植部位，考虑物种鉴定同时检测耐药基因；
有菌种特异性的耐药基因。
流行病学和感染控制学适应证
某种疾病聚集性发病或暴发，怀疑微生物导致但原因不明，且常规快速检测无结果；
感染性疾病患者有特殊区域旅游史，或特殊职业工作史，病原不明。
mNGS——应建立病原体分级标准
高等级的致病性病原体；
中等级的条件致病菌；
低等级的条件致病菌；
疑似背景微生物引起感染。
检测出的微生物有条件可通过PCR或其他实验室检查确认
可通过PCR验证的微生物（病毒、结核）
呼吸道标本；
分辨标本；
CSF标本；
血液标本。
可通过抗体检测验证的微生物
非典型病原体。
可通过其他方法验证的微生物
培养，涂片镜检等。
mNGS在感染性疾病诊断中的价值
疑“难”：不明原因感染诊断，病因排查；
危“重”：重症肺炎，脑膜炎，脓毒症等。
“特”殊：免疫低下人群，如移植患者，肿瘤患者等。
来源Focus聚焦呼吸介入 作者南京大学医学院附属金陵医院施毅
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